疯狂动物园作为一款融合跑酷与模拟经营的休闲游戏，其关卡挑战体系建立在多样化地图与动物生态的交互之上。游戏主要分为草原、丛林、山脉、澳洲、极地以及隐藏的侏罗纪公园等主题区域，每个区域包含基础动物驯服、稀有动物捕捉和BOSS挑战三层进阶内容。玩家需要通过骑乘动物完成跑酷任务，同时满足特定条件才能解锁隐藏动物，例如在草原地图中，暗黑野牛需要骑同一只野牛持续奔跑700米才会出现，而机械秃鹰则需在1400米后的特殊地形触发。
游戏的核心挑战机制围绕动物骑乘与栖息地建设展开。不同动物具备独特的移动特性：鸵鸟可短途滑翔规避障碍，狮子能延长骑乘时间，猩猩可跳跃通过复杂地形。玩家需根据地形特征灵活切换动物，例如丛林区域的鸭嘴河马需在水塘密集区域完成1600米骑乘，而山脉地图的蒸汽朋克耗牛则要求撞击10只动物才能激活。部分动物如恐龙犀牛需要连续换乘7种不同物种才能出现，这种设计强化了关卡探索的深度。
BOSS关卡作为终极挑战，通常需要综合运用地图机制与动物技能。草原的骷髅象、丛林的花样虎、极地的轮滑熊等BOSS，均要求玩家在高速跑酷中精准完成特定动作序列。例如火山猩猩关卡需利用环境光线判断其移动轨迹，在黑暗中进行三次有效射击；而凤凰鸸鹋则需要通过狮鹫吞噬其他凤凰来削弱其战斗力。这些战斗并非单纯依靠反应速度，更需要策略性规划骑乘路线与技能释放节奏。
隐藏关卡的解锁条件往往涉及跨区域协作。侏罗纪公园中的海怪甲龙需用甲龙撞击霸王龙才会随机生成，而花园地图的镜蜘蛛需要单局收集5个橡果。特殊时间机制也影响关卡开启，雄鸡鳄仅在设备时间显示早晨时出现，这种设计增加了探索的偶然性。玩家可通过栖息地升级来提升动物属性，但最终仍依赖操作精度与地形熟悉度完成高难度挑战。
游戏通过动物图鉴系统持续激励玩家挑战。目前已确认的85种动物分布在六大生态区，每完成一个区域的收集即可解锁新地图。虽然部分稀有动物如纯黑鹿需要连续换乘8种动物才能触发，但渐进式的难度曲线设计确保了挑战的可达性。关卡之间的逻辑衔接自然，从基础操作到复合技巧的过渡平滑，使玩家能持续获得攻克难关的满足感。
